Fakultas Ilmu Kesehatan, Universitas Perintis Indonesia menonjol dalam menawarkan serangkaian program akademik termasuk program Diploma III, Strata 1 dan Profesi. Fakultas Ilmu Kesehatan memiliki 6 program studi antara lain :

S1 Gizi

Terakreditasi B oleh LAM-PTKes
Masa studi Reguler 8 (delapan) Semester
Non Reguler 3 (tiga) Semester
Struktur Pembelajaran 70% Teori dan 30 Praktek
Kompetensi Lulusan:

• Mampu mengambil keputusan yang tepat pada penilaian status gizi dan ketahanan pangan individu, kelompok dan masyarakat
• Mampu melaksanakan penelitian dan memutakhirkan diri dalam perkembangan ilmu dan teknologi bidang gizi
• Mampu melakukan kegiatan advokasi dalam menangani masalah gizi
• Profil community leader
• Nutrition intervention and food services skill
• Profil manager
• Care provider

S1 Keperawatan

Terakreditasi B oleh LAM-PTKes
Masa studi Reguler 8 (delapan) Semester
Non Reguler 2 (dua) Semester
Struktur Pembelajaran 70% Teori dan 30% Praktek
Kompetensi Lulusan:

• Care Provider (Pemberi Asuhan Keperawatan)
• Community Leafleat (Pemimpin dalam kegiatan profesi maupun sosial)
• Edukator (Pendidikan kesehatan bagi klien dan keluarga
• Manager (pengelola asuhan keperawatan, researcher (peneliti pemula)

DIII Analis Kesehatan / Teknologi Laboratorium Medis 

Terakreditasi B oleh LAM-PTKes
Masa Studi 6 (enam) Semester
Struktur Pembelajaran 40% teori dan 60% Praktek
Kompetensi Lulusan:

• Teknisi flebotomi
• Teknisi laboratorium medik
• Verifikator proses pemeriksaan
• laboratorium medik
• Pelaksana promosi kesehatan laboratorium medik
• Asisten peneliti

DIV Analis Kesehatan / Teknologi Laboratorium Medis 

Terakreditasi B oleh LAM-PTKes
Masa Studi 8 (enam) Semester
Non Reguler 2 (dua) semester
Kompetensi Lulusan:

• Mampu menggunakan metode yang canggih pada pemeriksaan khusus  dan komplek
• Sebagai pengelola Laboratorium Kesehatan
• Sebagai validator hasil pemeriksaan laboratorium
• Sebagai asisten peneliti.

Profesi Ners

Terakreditas B oleh LAM-PTKes
Masa Studi 2 (dua) Semester
Struktur Pembelajaran: 100% Praktek Klinik
Kompetensi Lulusan:

• Mampu melaksanakan asuhan keperawatan yang professional dan akuntabel
• Menguasai Kegawat Daryratan dan Kebencanaan (Lulusan Mendapatkan Sertifikasi BTCLS dan Kebencanaan)